Bacilluse rakendatavad stsenaariumid hõlmavad peamiselt järgmisi aspekte:
Dairy Industry: toorpiimas domineerivad Bacillus bakterid, peamiselt piimatoodete talukeskkonnast. Piimatootmise ajal pääsevad need bakterid pastöriseerimisest ja ultra - kõrge temperatuuri steriliseerimisest ning kasutada piimas toitaineid ellujäämiseks ja idanemiseks.
Aquaculture: Bacillus mängib vesiviljeluses olulist rolli. Nad saavad tõhusalt ennetada ja kontrollida vesiviljeluse haigusi, lagundada kahjulikke aineid, sekretärides kasulikke ensüüme ja aineid ning soodustades mikroorganismide kasvu ja paljunemist vees, mängides sellega haiguste ennetamise rolli. Sobib magevee- ja merevee vesiviljeluseks, see võib kiirendada vetikate ja kontrollhaiguste kasvu vesiviljelusvetes.
Psa paranemist: pinnases kasutatakse laialdaselt ka baktereid. Nad võivad lagundada orgaanilisi aineid, soodustada mulla mikroorganismide tasakaalu, parandada mulla struktuuri ja suurendada mulla viljakust.
Bioengineeringu tehnoloogiauuringud: Bacillus subtilis on perekonna Bacilluse mudeliliik, mida kasutatakse laialdaselt rakkude diferentseerumisel ja bioinseneri tehnoloogiauuringutel. Kuna seda esineb laialdaselt erinevates keskkondades ning on vastupidav külma, kõrge temperatuuri ja tavaliste desinfitseerimisvahendite suhtes, kasutatakse seda sageli mudeliorganismina bakterite kromosoomi replikatsiooni ja muundamise uurimiseks.